El Fondo Documental de la Comisión de la Verdad se constituye en un patrimonio histórico para nuestra sociedad y al que le corresponde un lugar importante en la construcción de memoria del país y la comunidad internacional pues incluye pluralidad de voces de víctimas, comparecientes, testigos, comunidades, pueblos étnicos, jóvenes producto de las actividades de escucha; todas las contribuciones voluntarias de entidades, instituciones, organizaciones y personas; la documentación, bases de datos e información en general, relacionados con el conflicto armado y recopilados por la Comisión, así como el conjunto de evidencias documentales que registran el desarrollo de la gestión de la entidad en el cumplimiento de su mandato.
Todo esto esta materializado en las cerca de 15.000 entrevistas individuales y colectivas, los 1.195 informes y 730 casos sobre el conflicto armado, y los miles de recursos documentales que conforman el Fondo y que gracias a la declaratoria del Informe Final y el archivo de la entidad como un bien de interés cultural (Resolución No 420 del 26 de mayo de 2026 del Archivo General de la Nación) lo ubican dentro de la historia de colombiana como aporte a la memoria y la no repetición.
Durante el periodo de vigencia de la antigua Comisión, el pleno de comisionados definió que la titularidad del Fondo Documental de la Verdad en cabeza de la Jurisdicción Especial para la Paz en representación del Sistema Integral para la Paz. para lo cual se firmó el Acuerdo 05 del 25 de agosto del 2022, y así mismo recomendó que el Archivo General de la Nación - AGN “sea la entidad administradora y custodia y ejerza las labores conservación, preservación, protección, seguridad y acceso..” lo que se materializó con la firma del Convenio Marco Interadministrativo No. 682 de 2022 entre la JEP, el AGN y la Comisión.
Con el fin de formalizar la entrega del Fondo Documental y el Informe Final en su versión impresa a la JEP y el AGN, La Comisión de la Verdad en Liquidación, el 26 de agosto de 2026 fecha en la que dió por finalizada su tarea hizo entrega a estas entidades de los bienes materiales del Fondo y se divulgó la declaratoria de estos como Bien de interés Cultural de Carácter Documental Archivístico garantizando que tanto el Fondo como el Informe quedan cobijados por el Régimen Especial de Protección.